Zbiór cebuli zleży od metody i celu uprawy. Cebulę uprawianą na pęczki ze szczypiorem zbiera się wówczas, gdy średnica główki osiąga wielkość co najmniej 2,5 cm. Najwcześniej zbiera się cebulę z dymki i z siewu zimowego w lipcu, z rozsady w sierpniu, a z nasion koniec sierpnia i wrzesień. Cebulę przeznaczona do długotrwałego przechowywania lub na export zbiera się, gdy ok. 50% roślin ma złamany szczypior i wytworzy 2-3 łuski okrywające.

Dodatkową oznaką dojrzałości jest wiotczenie szyjki liściowej, zamieranie systemu korzeniowego i wytwarzanie suchych łusek okrywających, co trwa około 2 tygodni. Część cebul nie wykazuje skłonności do dojrzewania, szczypior nie łamie się, a szyjka nie zasycha. Jest to tak zwana cebula bączasta.

Taka cebula nie nadaje się do przechowywania. Na małych plantacjach cebule zbiera się ręcznie, układa się ją szczypiorem w jedną stronę, tak aby cebule z jednego rzędu były przykryte szczypiorem z drugiego rzędu. Następnie po przesuszeniu cebuli na polu przecina się szczypior i korzenie. Na większych plantacjach cebule zbiera się mechanicznie. Może to być zbiór jedno- lub dwufazowy. Dwufazowy zbiór cebuli mamy wtedy, gdy cebulę wykopiemy na plantacji. W Polsce robi się to za pomocą specjalnie do tego przystosowanej koparki do ziemniaków. Wykopana cebula jest dosuszana na polu przez kilka dni na polu. Następnie zbiera się cebule z pola mechanicznie i przewozi się do odpowiednich pomieszczeń, gdzie jest podsuszana, obcina szczypior i korzenie. Zbiór jednofazowy przeprowadzamy za pomocą specjalnych kombajnów do cebuli i gdy dysponujemy aktywną przechowalnię z nagrzanym powietrzem. Często zbiór cebuli jednofazowy poprzedzony jest zabiegiem desykacji.

W obrocie krajowym przyjęto cztery rodzaje cebuli:

• cebula młoda z zielonym szczypiorem, sprzedawana w pęczkach ok. 25 dkg
• cebula w pęczkach ze szczypiorem, o średnicy cebul powyżej 2,5 cm i masie pęczka ok. 0,5 kg
• cebula nie zaschnięta z obciętym szczypiorem, o średnicy nie mniejszej niż 4 cm
• cebula zaschnięta o średnicy nie mniejszej niż 3,5 cm z przeciętym szczypiorem na długość 4-6 cm i korzeniami do 1 cm lub usuniętych z zasuszoną szyjką, okryta dwoma warstwami nie popękanych łusek. Cebula powinna być jędrna, czysta i zdrowa.

Średni plon cebuli w Polsce wynosi około 30 t/ha. Cebula przeznaczona do obrotu powinna być jednolita pod względem kształtu, wielkości i barwy łuski, twarda, z dobrze dosuszoną i nie popękaną i dobrze przylegającą łuską.